Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SFR1Q86XK3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SFR1Q86XK3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SFR1Q86XK3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms