Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HAPLN4Q86UW8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HAPLN4Q86UW8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms