Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
FGD6Q6ZV73 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
FGD6Q6ZV73 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
FGD6Q6ZV73 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms