Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00173Q6ZV60 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00173Q6ZV60 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms