Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC73Q6ZRK6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC73Q6ZRK6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms