Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYP26C1Q6V0L0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CYP26C1Q6V0L0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYP26C1Q6V0L0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms