Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP12Q6UXS9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CASP12Q6UXS9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CASP12Q6UXS9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms