Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SCIMPQ6UWF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SCIMPQ6UWF3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms