Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMARCD3Q6STE5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMARCD3Q6STE5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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