Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ZBED9Q6R2W3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ZBED9Q6R2W3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZBED9Q6R2W3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms