Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCSAPQ6IQ19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCSAPQ6IQ19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCSAPQ6IQ19 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
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