Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C9orf57Q5W0N0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C9orf57Q5W0N0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C9orf57Q5W0N0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms