Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CROCCQ5TZA2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CROCCQ5TZA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CROCCQ5TZA2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms