Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HIVEP3Q5T1R4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIVEP3Q5T1R4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIVEP3Q5T1R4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms