Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM47AQ5JRC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM47AQ5JRC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM47AQ5JRC9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms