Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
P3H1Q32P28 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H1Q32P28 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms