Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SMN1Q16637 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMN1Q16637 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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