Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
STX1AQ16623 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STX1AQ16623 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STX1AQ16623 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
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