Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRIP13Q15645 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIP13Q15645 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIP13Q15645 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms