Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIP11Q15643 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIP11Q15643 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIP11Q15643 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms