Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCD11Q14690 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCD11Q14690 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDCD11Q14690 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
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