Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNA1CQ13936 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CACNA1CQ13936 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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