Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNFAIP1Q13829 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFAIP1Q13829 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TNFAIP1Q13829 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFAIP1Q13829 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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