Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BFSP2Q13515 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BFSP2Q13515 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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