Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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TUBB3Q13509 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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TUBB3Q13509 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TUBB3Q13509 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
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TUBB3Q13509 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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TUBB3Q13509 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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TUBB3Q13509 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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TUBB3Q13509 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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TUBB3Q13509 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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TUBB3Q13509 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBB3Q13509 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
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