Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB3BPQ13352 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB3BPQ13352 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB3BPQ13352 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms