Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH17Q12864 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDH17Q12864 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDH17Q12864 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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