Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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SYCNQ0VAF6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SYCNQ0VAF6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SYCNQ0VAF6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SYCNQ0VAF6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SYCNQ0VAF6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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