Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID5AQ03989 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID5AQ03989 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID5AQ03989 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms