Protein–RNA interactions for Protein: Q03938

ZNF90, Zinc finger protein 90, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF90Q03938 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF90Q03938 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF90Q03938 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms