Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PPARDQ03181 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARDQ03181 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms