Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EXOSC10Q01780 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
EXOSC10Q01780 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EXOSC10Q01780 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms