Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MC1RQ01726 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MC1RQ01726 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms