Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TFAP4Q01664 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TFAP4Q01664 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFAP4Q01664 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms