Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMF1P82094 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TMF1P82094 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMF1P82094 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMF1P82094 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMF1P82094 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TMF1P82094 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TMF1P82094 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TMF1P82094 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TMF1P82094 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMF1P82094 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMF1P82094 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TMF1P82094 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TMF1P82094 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMF1P82094 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMF1P82094 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMF1P82094 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMF1P82094 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TMF1P82094 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TMF1P82094 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMF1P82094 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMF1P82094 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMF1P82094 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMF1P82094 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMF1P82094 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TMF1P82094 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMF1P82094 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMF1P82094 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMF1P82094 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TMF1P82094 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMF1P82094 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMF1P82094 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMF1P82094 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TMF1P82094 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TMF1P82094 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TMF1P82094 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMF1P82094 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMF1P82094 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMF1P82094 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TMF1P82094 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TMF1P82094 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TMF1P82094 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TMF1P82094 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TMF1P82094 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
TMF1P82094 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TMF1P82094 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMF1P82094 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMF1P82094 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMF1P82094 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMF1P82094 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TMF1P82094 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMF1P82094 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TMF1P82094 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMF1P82094 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMF1P82094 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMF1P82094 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMF1P82094 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMF1P82094 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMF1P82094 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMF1P82094 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TMF1P82094 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TMF1P82094 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMF1P82094 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TMF1P82094 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMF1P82094 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMF1P82094 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMF1P82094 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMF1P82094 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TMF1P82094 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TMF1P82094 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TMF1P82094 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms