Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIM1P81133 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIM1P81133 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIM1P81133 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIM1P81133 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIM1P81133 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIM1P81133 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIM1P81133 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIM1P81133 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIM1P81133 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms