Protein–RNA interactions for Protein: P62195

PSMC5, 26S proteasome regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC5P62195 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMC5P62195 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMC5P62195 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMC5P62195 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms