Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS3AP61247 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPS3AP61247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms