Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMDP57764 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMDP57764 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms