Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBASH3AP57075 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBASH3AP57075 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms