Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STX17P56962 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STX17P56962 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STX17P56962 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STX17P56962 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STX17P56962 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STX17P56962 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX17P56962 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX17P56962 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STX17P56962 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX17P56962 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX17P56962 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX17P56962 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX17P56962 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX17P56962 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX17P56962 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX17P56962 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX17P56962 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STX17P56962 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX17P56962 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms