Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP1P56182 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP1P56182 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP1P56182 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP1P56182 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP1P56182 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP1P56182 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP1P56182 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP1P56182 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP1P56182 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP1P56182 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP1P56182 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP1P56182 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP1P56182 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP1P56182 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP1P56182 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP1P56182 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP1P56182 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP1P56182 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP1P56182 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP1P56182 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP1P56182 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP1P56182 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP1P56182 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1P56182 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1P56182 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1P56182 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1P56182 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1P56182 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP1P56182 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP1P56182 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP1P56182 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms