Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CASP9P55211 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CASP9P55211 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP9P55211 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP9P55211 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CASP9P55211 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASP9P55211 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASP9P55211 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP9P55211 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP9P55211 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASP9P55211 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASP9P55211 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASP9P55211 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP9P55211 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP9P55211 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CASP9P55211 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms