Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAP1L1P55209 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L1P55209 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L1P55209 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms