Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NRLP54845 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NRLP54845 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NRLP54845 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NRLP54845 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NRLP54845 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRLP54845 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRLP54845 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NRLP54845 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NRLP54845 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NRLP54845 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRLP54845 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRLP54845 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRLP54845 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRLP54845 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRLP54845 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NRLP54845 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRLP54845 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRLP54845 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRLP54845 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRLP54845 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NRLP54845 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NRLP54845 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NRLP54845 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NRLP54845 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NRLP54845 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms