Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA8P53708 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA8P53708 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms