Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THOP1P52888 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THOP1P52888 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THOP1P52888 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THOP1P52888 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THOP1P52888 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THOP1P52888 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THOP1P52888 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THOP1P52888 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THOP1P52888 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THOP1P52888 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THOP1P52888 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THOP1P52888 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THOP1P52888 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THOP1P52888 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THOP1P52888 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THOP1P52888 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THOP1P52888 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms