Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF138P52744 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF138P52744 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms