Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRP3P50461 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CSRP3P50461 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSRP3P50461 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms