Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GRIA4P48058 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIA4P48058 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms